50千瓦发电机组发生敲缸故障时，可以采取以下措施进行处理：
1.检查和确认故障：首先，需要确认是否真的是敲缸故障。敲缸通常表现为发动机在怠速时异响明显，加油后减弱；而在高温状态下异响减弱或消失。可以通过听诊棒仔细听诊，确定异响来源。
2.低温运行检查：如果发动机在低温运行时出现敲击声，但在温度正常后声音消失，可以暂时不处理，继续运行。
3.避免高速运行：如果发动机在正常工作温度下仍有明显的敲击声，应尽量避免高速运行，并尽快拆卸维修。
4.拆卸检查和维修：拆下气缸盖并抽出活塞进行检查。如果发现气缸严重失圆、拉伤，或者活塞和气缸的间隙太大，应进行更换，包括气缸套、活塞及活塞环。如果连杆变形，也应进行更换。
5.润滑和机油更换：检查机油压力和粘度，必要时更换质量高的机油。清理润滑油管堵塞，确保润滑油道畅通。
6.清理积碳和更换配件：清理发动机积碳，更换损坏的配件，如活塞连杆、爆震传感器等。
7.调整供油时间和喷油提前角：如果供油时间过早导致敲缸，可以调整供油提前角，延迟喷油时间。
8.定期保养：定期检查和维护发电机组，避免因维护不当导致的故障。保持发动机清洁，使用合适的机油和燃油。
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